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Material Apoio
Textos, slides e material suplementar, por tema de aula.
O material suplementar não é uma lista completa de tópicos ou literatura sobre o assunto, mas uma coletânea parcial, pessoal e passional feita pelos professores.
À medida que a disciplina avança, incluiremos referências para artigos, livros, pessoas e sites que se mostrem importantes nas discussões e aulas teóricas.
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Para cada tema há os seguintes textos:
Introdutórios: leitura obrigatória antes da primeira aula de cada tema, seja discussão, seja exercício.
Para Discussão: leitura obrigatória antes das aulas de discussão sobre cada tema.
Suplementares: leitura opcional, para aprofundar-se no tema.
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Introdução à Ecologia de comunidades
Leituras
Para discussão
Slides
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Slides da aula - 2010:
pdf
Slides da aula - 2009:
pdf
Material Suplementar
Joan Roughgarden
Nicho, Competição e Estutura de Comunidades
Leituras
Introdutórias
Para discussão
Hoogenboom M.O., Connolly, S.R. 2009. Defining fundamental niche dimensions of corals: synergistic effects of colony size, light, and flow. Ecology 90(3):767-780.
Slides
Aula 2011 - nicho e competição:
pdf
Aula 2010 - competição:
pdf.
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Material Suplementar
O fantasma da competição passada: J.H. Connell, Diversity and the coevolution of competitors, or the ghost of competition past. Oikos 35 (1980), pp. 131–138.
Processos estabilizadores x diversificadores: Adler P.B., Hillerislambers, J. & Levine, J.M. 2007. A niche for neutrality. Ecology Letters, 10:95-104.
Niche Construction, site dos autores da idéia, com vários
links para artigos e para o livro.
G. Evelyn Hutchinson
George Evelyn Hutchinson: 20 th-century ecologist. LB SLOBODKIN, NG SLACK Endeavour 23:11, 24-30, Elsevier Science, 1999 - Inclui a árvore de descendentes intelectuais de Hutchinson.
Predação e estrutura de comunidades
Leituras
Introdutórias
Para discussão
Slides
Aula 2011- Predação e estrutura de comunidades:
pdf
Aula 2010 - Interações Indiretas Mediadas pela Densidade:
pdf.
Aula 2010 - Interações Indiretas Mediadas pelos Atributos:
pdf.
Material Suplementar
Hipótese do mundo verde: Hairston N G, Smith F E & Slobodkin L B. Community structure, population control, and competition. Amer. Naturalist 94:421-5, 1960.
Equilíbrio em Sistemas Dinâmicos
Leituras
Introdutórias
Para discussão
Allesina, S. & Pascual M. 2007. Network structure, predator–prey modules, and stability in large food webs. Theoretical Ecology, 1(1), 55-64.
Material suplementar
May, R.M. 1972. Will a large complex system be stable? Nature, 238, 413-414. O artigo clássico que estabeleceu o conceito de equilíbrio de redes tróficas como solução de um sistema de equações de Lotka-Volterra. Vale apena rastrear as citações na Web of Science.
May, R.M. 2001. Stability and complexity in model ecosystems. Princeton Univ Press. Nesta influente monografia Robert May desenvolve as idéias do artigo de 1972. A primeira edição é de 1973, e o livro foi re-editado na coleção
Princeton Landmarks of Biology em 2001.
Biografia de Robert May, Barão de Oxford, no
site da Oxford University.
Tang, S. & Allesina, S. ms. Stability criteria for complex ecosystems. Generalização das condições de equilíbrio deduzidas por May (1972). Versão de trabalho no Arxiv:
http://arxiv.org/abs/1105.2071.
Teorias Neutras da biodiversidade
Leituras
Introdutórias
Alonso, D., R. S. Etienne, and A. J. Mckane 2006. The merits of neutral theory. Trends in Ecology & Evolution 21: 451-457.
Chave, J. Competition, Neutrality, and Community Organization. Cap. III.2.The Princeton Guide to Ecology.
Para discussão
Hubbell, S.P. 1979. Tree dispersion, abundance, and diversity in a tropical dry forest. Science 203: 1299-1309.
Harpole, W.S., Tilman, D. 2006. Non-neutral patterns of species abundance in grassland communities. Ecology Letters 9: 15-23.
Slides
Material suplementar
Teorias que Hubbel Usou
Excelente livro básico sobre modelos estocásticos. Há
um exemplar na biblioteca do IB. O capítulo 2 cobre os modelos básicos de deriva em populações:
A proposta por Stephen Hubbell
Rosindell, J., Hubbell, S. P. & Etienne, R. S. 2011. The Unified Neutral Theory of Biodiversity and Biogeography at Age Ten. Trends in Ecology & Evolution 26:340-348.
Brian McGill
Uma boa revisão da evidência empírica até a época, com comparações com outros modelos neutros: Brian J. McGill, Brian A. Maurer, Michael D. Weiser (2006) EMPIRICAL EVALUATION OF NEUTRAL THEORY. Ecology: Vol. 87, No. 6, pp. 1411-1423.
Estabilização x Diversificação
Scheffer, M., van Nes, E. H., April 2006. Self-organized similarity, the evolutionary emergence of groups of similar species. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 103 (16), 6230-6235.
http://www.pnas.org/content/103/16/6230.long
Adler P.B., Hillerislambers, J. & Levine, J.M. 2007. A niche for neutrality. Ecology Letters, 10:95-104.
Biogeografia de ilhas
Leituras
Introdutórias
Gotelli, N.J. 2007 Ecologia. Cap. 7 - Biogeografia de ilhas. Pp. 159-181. Ed. Planta.
Robert MacArthur & Edward Wilson 1967. The importance of islands. Cap.1 do livro The theory of island biogeography.
Para discussão
Simberloff, D. & Wilson, E. 1969. Experimental zoogeography of islands: the colonization of empty islands Ecology, Ecology 50: 278-296.
Kreft, H., Jetz, W., Mutke, J., Kier, G., & Barthlott, W. (2008). Global diversity of island floras from a macroecological perspective. Ecology letters, 11(2), 116-27.
Material suplementar
Leituras
Introdutórias
Logue, J. B., Mouquet, N., Peter, H. & Hillebrand, H. 2011. Empirical approaches to metacommunities: a review and comparison with theory. Trends in Ecology & Evolution, 26(9).
Para discussão
Slides
Material suplementar
Holyoak, M., Leibold, M. A. & Holt, R. D. 2005. Metacommunities: spatial dynamics and ecological communities. University of Chicago Press.
Google books. Disponível na
biblioteca do IB-USP
Processos históricos e biogeográficos
Leituras
Introdutórias
Para discussão
Slides
Material suplementar
Wiens, J.J. & Donoghue, M.J. 2004. Historical biogeography, ecology and species richness. TREE 19: 639-644.
Brooker, R.W., Callaway, R.M., Cavieres, L., Kikvidze, Z., Lortie, C.J., Michalet, R., Pugnaire, F.I., et al. 2009. Don’t diss integration: a comment on Ricklefs's disintegrating communities. The American naturalist 174(6), 919-27
Ricklefs, R.E. & Schluter, D. 1993. Species diversity in ecological communities: historical and geographical perspectives. University of Chicago Press, Chicago.
Excelente história da teoria ecológica. Há
um exemplar na biblioteca do IB. O último capítulo e posfácio abordam a retomada da história em uma ecologia dominada pelos modelos de dinâmica local: Kingsland, S. 1995. Modeling nature-Episodes in the history of population ecology. The Chicago University Press, Chicago.
Resiliência e Estados Múltiplos
Leituras
Introdutórias
Scheffer, M. 2009. Alternative Stable States. In: Critical Transitions in Nature and Society, Chapter II, pp. 11-36, Princenton University Press.
pdf
Para discussão
Blindow I. et al. 1993. Long-term pattern of alternative stable states in two shallow eutrophic lakes. Freshwater Biology 30: 159-167.
pdf
Persson et al. 2007. Culling prey promotes predator recovery — alternative states in a whole-lake experiment. Science 316: 1743-1746.
pdf,
Supporting online material.
Slides
Material suplementar
Holling C.S. 1973. Resilience and stability of ecological systems. Annu. Rev. Ecol. Syst. 4: 1-23.
pdf
Scheffer, M. et al. 2001. Catastrophic shifts in ecosystems.
Nature 413: 591-596.
pdf
Beisner, B.E. et al. 2003. Alternative stable states in ecology.
Front. Ecol. Environ. 1: 376–382.
pdf
Elmqvist et al. 2003. Response diversity, ecosystem change, and resilience.
Frontiers in Ecology and Environment1: 488–494.
pdf
Folke, C. et al. 2004. Regime shifts, resilience, and biodiversity in ecosystem management.
Annu. Rev. Ecol. Evol. Syst. 35: 557–81.
pdf
Grimm, V. & Wissel, C. 1997. Babel, or the ecological stability discussions: an inventory and analysis of terminology and a guide for avoiding confusion.
Oecologia 109: 323–334.
pdf
May, R.M. 1997. Thresholds and breakpoints in ecosystems with a multiplicity of stable states.
Nature 269: 471-477.
pdf
Peterson, G. et al. 1998. Ecological Resilience,Biodiversity, and Scale.
Ecosystems 1: 6–18.
pdf
Scheffer, M. et al. 2009. Early-warning signals for critical transitions.
Nature 461: 53-59.
pdf
Schröder, A. et al. 2005. Direct experimental evidence for alternative stable states: a review.
Oikos 110: 3-19.
pdf
van Nes, E.H. & Scheffer, M. 2004. Large species shifts triggered by small forces.
Am. Nat. 164: 255-266.
pdf
Walker, B. et al. 2004. Resilience, Adaptability and Transformability in Social–ecological Systems.
Ecology and Society 9:5.
pdf
Pardini et al. 2010. Beyond the fragmentation threshold hypothesis: regime shifts in biodiversity across fragmented landscapes.
PLoS ONE 5 e13666
Hirota et al. 2011. Global resilience of tropical forest and savanna to critical transitions. Science 334: 232-235.
pdf
Integrando abordagens
Leitura para discussão
Vellend, M. 2010. Conceptual synthesis in community ecology.
THE QUARTERLY REVIEW OF BIOLOGY 85: 183-206.
pdf
Outros Tópicos
Estatística e análise de padrões
Food webs
Gary Polis
Polis, G.A. 1991. Complex trophic interactions in deserts: an empirical critique of food web theory. Am. Nat. 138, 123–155.
pdf
Polis, G.A. 1996. Food Web Complexity and Community Dynamics. The American Nuturalist: 147 :813-846.
pdf
Modelos Nulos
Manly, B.F.J. 2007. Randomization, bootstrap and Monte Carlo methods in biology, third edition. Chapman & Hall/CRC.
Cody,M.L. & Diamond, J.M. 1975 (Eds). Ecology and evolution of communities. Massachusetts, Belknap Press.
Strong, D.R., Simberloff, D., Abele, L.G., Thistle, A.B. 1984 (Eds). Ecological communities: conceptual issues and the evidence. Princeton Univ. Press.
Nicholas Gotelli:
Página na internet, com
links para o pacote Ecosim, publicações, incluindo referência básica sobre modelos nulos (de onde veio a figura deste wiki):
Gotelli, N.J., and G.R. Graves. 1996. Null Models in Ecology. Smithsonian Institution Press, Washington, DC.
pdf.
Robert Colwell:
Página na internet, com muitos
links para artigos, programas, e muito mais, incluindo:
RangeModel, programa para testar modelos nulos de distribuição geográfica de espécies.
EM RESUMO:
<WRAP right> Nuvem de palavras dos títulos das leituras obrigatórias. Feito com Wordle!</WRAP>