planeco:roteiro:10-glm
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planeco:roteiro:10-glm [2017/03/28 23:10] – [Interpretação do resultado] adalardo | planeco:roteiro:10-glm [2025/05/06 18:24] (Atual) – adalardo | ||
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Linha 1: | Linha 1: | ||
+ | ====== Aviso ====== | ||
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+ | ===== ** Essa versão está desatualizada ** ===== | ||
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====== Modelo Lineares Generalizados ====== | ====== Modelo Lineares Generalizados ====== | ||
Linha 16: | Linha 31: | ||
O preditor linear está baseado na estrutura linear que temos visto nos modelos. Para uma variável preditora: | O preditor linear está baseado na estrutura linear que temos visto nos modelos. Para uma variável preditora: | ||
- | $$ \eta = \alpha + \beta * x$$ | + | $$ \eta = \alpha + \beta x$$ |
A função de ligação é o que relaciona o preditor linear com a esperança: | A função de ligação é o que relaciona o preditor linear com a esperança: | ||
Linha 119: | Linha 134: | ||
===== GLM Binomial ===== | ===== GLM Binomial ===== | ||
- | Os modelos de proporção ou de resposta binária (presença/ | + | Os modelos de proporção ou de resposta binária (presença/ |
- | + | ||
===== Função de ligação ===== | ===== Função de ligação ===== | ||
Linha 138: | Linha 153: | ||
* area: área total da ilha ($km^2$) | * area: área total da ilha ($km^2$) | ||
* isolation: distância do continente (km) | * isolation: distância do continente (km) | ||
+ | </ | ||
+ | |||
+ | |||
+ | <WRAP center round important 60%> | ||
+ | ** Use os mesmos passos do modelo anterior no Rcmdr ** | ||
+ | * lembre-se que a '' | ||
+ | * o procedimento para a sobre-dispersão é o mesmo que no exemplo anterior | ||
+ | * | ||
</ | </ | ||
Linha 152: | Linha 175: | ||
O modelo prevê a ocorrência da ave na escala de logaritmo da chance (log odds-ratio). Para interpretar tanto os coeficientes quanto os valores previsto é necessário aplicar a função inversa do '' | O modelo prevê a ocorrência da ave na escala de logaritmo da chance (log odds-ratio). Para interpretar tanto os coeficientes quanto os valores previsto é necessário aplicar a função inversa do '' | ||
- | $$logit^1(\hat{y}) = \frac{1}{1+\frac{1}{e^{\hat{y}}}} $$ | + | $$logit^{-1}(\hat{y}) = \frac{1}{1+\frac{1}{e^{\hat{y}}}} $$ |
+ | |||
+ | * calcule o predito pelo modelo e os coeficientes na escala original | ||
+ | * interprete o efeito do tamanho e distância na ocorrência da espécie | ||
+ | |||
+ | |||
+ | ===== Modelo Linear Misto ===== | ||
+ | |||
+ | Para construir modelos onde as observações têm dependência espacial ou temporal, é preciso contemplar a variável com dependência como variável aleatória. | ||
+ | |||
+ | <WRAP center round box 80%> | ||
+ | **__// | ||
+ | |||
+ | Os pacotes para trabalhar os modelos mistos no R não são instalados junto com os pacotes básicos como os que contem as funções '' | ||
+ | Os dois principais pacotes para realizar modelos misto são: '' | ||
+ | |||
+ | < | ||
+ | install.packages(" | ||
+ | library(lme4) | ||
+ | </ | ||
+ | |||
+ | </ | ||
+ | |||
+ | |||
+ | Para um modelo onde a relação entre a preditora e a resposta não mudam, mas há um efeito relacionado aleatório relacionado à localidade ou o objeto da medida, construímos usamos o LMM da seguinte forma. | ||
+ | <WRAP center round box 80%> | ||
+ | * baixe o arquivo {{ : | ||
+ | * ajuste um modelo com a variável aleatória '' | ||
+ | * compare o modelo com e sem a preditora '' | ||
+ | * interprete o resultado do modelo mínimo adequado | ||
+ | |||
+ | </ | ||
+ | |||
+ | |||
+ | < | ||
+ | lmm01r <- lmer(Richness ~ NAP + (1|Beach), data=praia, REML = FALSE) | ||
+ | lmm00r <- lmer(Richness ~ 1 + (1|Beach), data=praia, REML = FALSE) | ||
+ | anova(lmm00r, | ||
+ | lmm01 <- lmer(Richness ~ NAP + (1|Beach), data=praia, REML = TRUE) | ||
+ | summary(lm001) | ||
+ | |||
+ | </ | ||
+ | |||
+ | Para incluir a variável aleatória '' | ||
+ | $$(1|Beach) $$ | ||
+ | para: | ||
+ | |||
+ | $$(1 + NAP|Beach) $$ | ||
+ | |||
+ | <WRAP center round box 60%> | ||
+ | * construa o modelo com a variável aleatória '' | ||
+ | * interprete o resultado | ||
+ | |||
+ | </ | ||
+ |
planeco/roteiro/10-glm.1490742601.txt.gz · Última modificação em: 2024/01/09 18:38 (edição externa)