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Página da disciplina, oferecida pelo Programa de Pós-Graduação em Ecologia e Conservação da Biodiversidade da Universidade de Santa Cruz.
Aqui você encontra o material de apoio para a disciplina.
blog:quantif
Baixe os arquivos das funções em R, o roteiro, e o arquivo com os comandos. Siga as instruções do roteiro.
Baixe todos os arquivos para seu diretório de trabalho. Siga as instruções do roteiro.
Censo de árvores com DAP maior ou igual a 5 cm em duas parcelas permanentes instaladas em florestas tropicais.
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Os arquivos devem ter o mesmo nome que está neste site para que o código de R funcione. </box>
Parcela Permanente da Ilha do Cardoso: floresta de restinga, com área de 10 ha.
Parcela Permanente da Ilha de Barro Colorado: floresta sazonal tropical, com área de 50 ha.
<bibtex> @BOOK{Magurran2004,
title = {Measuring Biological Diversity},
publisher = {Blackwell},
address = {London},
year = {2004},
author = {Magurran, A.E.},
%file={:reservada:bib:magurran2004.pdf}
} @INCOLLECTION{May1975,
author = {May, R. M.},
title = {Patterns of Species Abundance and Diversity},
booktitle = {Ecology and Evolution of Communities},
publisher = {Harvard University Press},
year = {1975},
editor = {Cody, Martin L. and Diamond, Jared M. },
chapter = {4},
pages = {81--120},
address = {Cambridge, MA},
%file={:reservada:bib:may1975.pdf}
} @BOOK{Pielou1975,
title = {Ecological Diversity},
publisher = {Wiley Interscience},
year = {1975},
author = {Pielou, E. C.},
address = {New York},
owner = {paulo},
timestamp = {2008.12.20}
} </bibtex>
<bibtex> @ARTICLE{McGill2007,
author = {McGill, B.J. and Etienne, R.S. and Gray, J.S. and Alonso, D. and
Anderson, M.J. and Benecha, H.K. and Dornelas, M. and Enquist, B.J.
and Green, J.L and He, F. and Hurlbert, A.H. and Magurran, A. E.
and Marquet, P.A. and Maurer, B.A. and Ostling, A. and Soykan, C.U.
and Ugland, K.I. and White, E.},
title = {Species abundance distributions: moving beyond single prediction
theories to integration within an ecological framework},
journal = {Ecology Letters},
year = {2007},
volume = {10},
pages = {995-1015},
number = {10},
%file={:reservada:bib:mcgill2007.pdf}
}
@ARTICLE{Prado2010,
author = {Prado, P I},
title = {Distribuições de Abundâncias de Espécies: avanços analíticos para entender um padrão básico em ecologia},
journal = {Ciência e Ambiente},
year = {2010},
volume = {no prelo},
file={:projetos:prado_2010.pdf}
} </bibtex>
<bibtex> @ARTICLE{Hill1973,
author = {Hill, M O},
title = {Diversity and evenness: a unifying notation and its consequences},
journal = {Ecology},
year = {1973},
volume = {54},
pages = {427--432},
number = {2},
publisher = {JSTOR},
%file={:reservada:bib:hill1973.pdf}
}
@article{Hubalek2000,
title={Measures of species diversity in ecology: an evaluation},
author={Hub{\'a}lek, Z.},
journal={Folia Zoologica},
volume={49},
number={4},
pages={241--260},
year={2000},
%file={:reservada:bib:hubalek2000.pdf}
}
@article{melo2008,
title={O que ganhamos confundindo riqueza de espécies e equabilidade em um índice de diversidade?},
author={Melo, A.S.},
journal={Biota Neotropica},
volume={8},
year={2008},
publisher={SciELO Brasil},
url={http://www.biotaneotropica.org.br/v8n3/pt/fullpaper?bn00108032008+pt}
} @article{Patil1982,
title={Diversity as a concept and its measurement},
author={Patil, GP and Taillie, C.},
journal={Journal of the American Statistical Association},
volume={77},
number={379},
pages={548--561},
year={1982},
publisher={JSTOR},
%file={:reservada:bib:patil1982.pdf}
} </bibtex>
<bibtex> @ARTICLE{Gotelli2001,
author = {N J Gotelli and R K Colwell},
title = {Quantifying biodiversity: procedures and pitfalls in the measurement
and comparison of species richness},
journal = {Ecology Letters},
year = {2001},
volume = {4},
pages = {379-391},
owner = {paulo},
timestamp = {2008.12.16},
%file= {:reservada:bib:gotelli2001.pdf}
}
@article{schilling2008,
title={Curva de acumulação de espécies e suficiência amostral em florestas tropicais},
author={Schilling, A.C. and Batista, J.L.F.},
journal={Revista Brasileira de Botânica},
volume={31},
pages={179--187},
year={2008},
publisher={SciELO Brasil},
url={http://www.scielo.br/scielo.php?pid=S0100-84042008000100016&script=sci_abstract&tlng=pt}
}
@article{Tipper1979,
title={Rarefaction and rarefiction-the use and abuse of a method in paleoecology},
author={Tipper, J.C.},
journal={Paleobiology},
volume={5},
number={4},
pages={423--434},
year={1979},
publisher={JSTOR},
%file={:reservada:bib:tipper79.pdf}
}
</bibtex>
<bibtex> @article{colwell1994,
title={Estimating terrestrial biodiversity through extrapolation},
author={Colwell, R.K. and Coddington, J.A.},
journal={Philosophical Transactions: Biological Sciences},
volume={345},
number={1311},
pages={101--118},
year={1994},
publisher={JSTOR},
%file={:reservada:bib:colwell1994.pdf}
}
@MANUAL{colwell2006,
title = {EstimateS User’s guide: Statistical estimation of species richness
and shared species from samples. Version 8.2},
author = {Colwell, RK},
address = {Storrs, Connecticut},
year = {2009},
url = {http://viceroy.eeb.uconn.edu/EstimateSPages/EstSUsersGuide/EstimateSUsersGuide.htm}
}
@INBOOK{Santos2003,
pages = {19--41},
title = {Estimativas de riqueza em espécies},
publisher = {UFPR/Fund. Boticário},
year = {2003},
editor = {Cullen, L., Jr. and Rudram, R. and Valladares-Pádua, C.},
author = {Santos, A},
address = {Curitiba},
booktitle = {Métodos de estudos em biologia da conservação e manejo
da vida silvestre},
owner = {paulo},
timestamp = {2010.06.07}
} </bibtex>
<bibtex> @article{crist2003,
title={Partitioning species diversity across landscapes and regions: a hierarchical analysis of $$\alpha$$, $$\beta$$, and $$\gamma$$ diversity},
author={Crist, T.O. and Veech, J.A. and Gering, J.C. and Summerville, K.S.},
journal={The American Naturalist},
volume={162},
pages={734--743},
year={2003},
publisher={Univ. Chicago Press},
%file={:reservada:bib:crist2003.pdf}
}
@article{wagner2000,
title={Additive partitioning of plant species diversity in an agricultural mosaic landscape},
author={Wagner, H.H. and Wildi, O. and Ewald, K.C.},
journal={Landscape Ecology},
volume={15},
number={3},
pages={219--227},
year={2000},
publisher={Springer},
%file={:reservada:bib:wagner2000.pdf}
}
@article{veech2002,
title={The additive partitioning of species diversity: recent revival of an old idea},
author={Veech, J.A. and Summerville, K.S. and Crist, T.O. and Gering, J.C.},
journal={Oikos},
pages={3--9},
year={2002},
%file={:reservada:bib:veech2002.pdf}
}
</bibtex>