Diferenças

Aqui você vê as diferenças entre duas revisões dessa página.

Link para esta página de comparações

Próxima revisão
Revisão anterior
exercicios:exe_r [2012/05/03 21:53] – edição externa 127.0.0.1exercicios:exe_r [2024/01/09 18:18] (atual) – edição externa 127.0.0.1
Linha 11: Linha 11:
  
 A seguir são apresentados roteiros para os exercícios no R.\\      Atente-se ao tema e ao objetivo de cada exercício proposto.\\      Nos roteiros você encontrará as instruções que devem ser seguidas na ordem em que são propostas. É muito importante que você não pule nenhum passo, seu exercício pode dar errado por fazer isso!\\ Além do que fazer, em alguns passos haverá dicas de comandos no R que você pode utilizar.\\ Sempre que houver dúvidas, lembre-se de buscar o **help do R**.\\ No **help do R** você encontra tudo o que precisa saber para executar comandos e montar as suas funções ;-). A seguir são apresentados roteiros para os exercícios no R.\\      Atente-se ao tema e ao objetivo de cada exercício proposto.\\      Nos roteiros você encontrará as instruções que devem ser seguidas na ordem em que são propostas. É muito importante que você não pule nenhum passo, seu exercício pode dar errado por fazer isso!\\ Além do que fazer, em alguns passos haverá dicas de comandos no R que você pode utilizar.\\ Sempre que houver dúvidas, lembre-se de buscar o **help do R**.\\ No **help do R** você encontra tudo o que precisa saber para executar comandos e montar as suas funções ;-).
-{{:ecopop:exercicios:rlogo.jpg?100|  }}+{{:exercicios:rlogo.jpg?100|  }}
 Para uma revisão da lingagem R visite o site da disciplina [[http://ecologia.ib.usp.br/bie5782| Introdução à Linguagem R]]. Lá encontrará aulas, tutoriais e uma postila online.  Para uma revisão da lingagem R visite o site da disciplina [[http://ecologia.ib.usp.br/bie5782| Introdução à Linguagem R]]. Lá encontrará aulas, tutoriais e uma postila online. 
  
  
-** Cartão de Referência com as principais funções do R em {{:ecopop:exercicios:r-refcard.pdf|}} ** Imprima e tenha sempre em mãos para lembrar os nomes das funções mais usuais. É o vocabulário básico para a linguagem.+** Cartão de Referência com as principais funções do R em {{exercicios:r-refcard.pdf|}} ** Imprima e tenha sempre em mãos para lembrar os nomes das funções mais usuais. É o vocabulário básico para a linguagem.
  
 Abaixo o código de uma função base para os exercícios de projeção de crescimento populacional que pode ser usada como estrutura básica para as suas funções. No caso é uma funcão com 3 argumentos: número de indivíduos no tempo 0 (No), taxa de crescimento populacional (lam) e o tempo máximo (tmax) de projeção da população.   Abaixo o código de uma função base para os exercícios de projeção de crescimento populacional que pode ser usada como estrutura básica para as suas funções. No caso é uma funcão com 3 argumentos: número de indivíduos no tempo 0 (No), taxa de crescimento populacional (lam) e o tempo máximo (tmax) de projeção da população.  
Linha 57: Linha 57:
 ii) Representar graficamente a superfície de verosimilhança.\\ ii) Representar graficamente a superfície de verosimilhança.\\
  
-  * **Roteiro do exercício em planilha do Excel [[ecopop:exercicios:exe_ver|Verossimilhança]]** +  * **Roteiro do exercício em planilha do Excel [[:exercicios:exe_ver|Verossimilhança]]** 
-  * **Roteiro do exercício no R [[ecopop:exercicios:exe_verr|VerossimilhançaR]]**+  * **Roteiro do exercício no R [[:exercicios:exe_verr|VerossimilhançaR]]**
  
  
Linha 74: Linha 74:
 Em seguida, utilizando a mesma base da função de crescimento determinístico contínuo,  projetaremos uma população com estocasticidade ambiental, criando variação na taxa de crescimento. Nesse caso o resultado deverá ser uma tabela com a projeção das duas condições contínuas (com e sem variação) e o gráfico comparando a duas populações projetadas.  Em seguida, utilizando a mesma base da função de crescimento determinístico contínuo,  projetaremos uma população com estocasticidade ambiental, criando variação na taxa de crescimento. Nesse caso o resultado deverá ser uma tabela com a projeção das duas condições contínuas (com e sem variação) e o gráfico comparando a duas populações projetadas. 
  
-**Roteiro  [[ecopop:exercicios::exerc2|Exercício II.1]]**+**Roteiro  [[:exercicios::exerc2|Exercício II.1]]**
  
 ==== II.2 Estocasticidade Demográfica  ==== ==== II.2 Estocasticidade Demográfica  ====
Linha 84: Linha 84:
  
  
-** Roteiro [[ecopop:exercicios:exe3v|Estocasticidade Demográfica]]**+** Roteiro [[:exercicios:exe3v|Estocasticidade Demográfica]]**
  
 ---- ----
Linha 95: Linha 95:
 O exercício III tem como objetivo projetar populações com crescimento logístico contínuo e discreto. No exercício anterior, sobre crescimento exponencial, as flutuações populacionais eram independentes da densidade. Nos modelos de crescimento logístico as populações sofrem o efeito da superlotação. Este efeito da denso-dependência está associado a K (capacidade suporte), que será mais um argumento a ser acrescentado na sua função. Basicamente, os passos deste exercício são os mesmos do exercício II. O que irá mudar serão os cálculos, que agora irão incorporar o efeito da denso-dependência. A segunda parte deste exercício tem como objetivo mostrar como a ordem subjacente a um comportamento caótico pode ser facilmente reconhecida através de uma representação gráfica.  O exercício III tem como objetivo projetar populações com crescimento logístico contínuo e discreto. No exercício anterior, sobre crescimento exponencial, as flutuações populacionais eram independentes da densidade. Nos modelos de crescimento logístico as populações sofrem o efeito da superlotação. Este efeito da denso-dependência está associado a K (capacidade suporte), que será mais um argumento a ser acrescentado na sua função. Basicamente, os passos deste exercício são os mesmos do exercício II. O que irá mudar serão os cálculos, que agora irão incorporar o efeito da denso-dependência. A segunda parte deste exercício tem como objetivo mostrar como a ordem subjacente a um comportamento caótico pode ser facilmente reconhecida através de uma representação gráfica. 
  
-**Roteiro do exercício [[ecopop:exercicios::exe3|Exercício III.1]]**+**Roteiro do exercício [[:exercicios::exe3|Exercício III.1]]**
  
 ==== III.2. Logistico discreto x Exponencial Estocástico ==== ==== III.2. Logistico discreto x Exponencial Estocástico ====
Linha 101: Linha 101:
 Este exercício tem como objetivo fazer uma comparação do crescimento logístico discreto com o crescimento exponencial estocástico discreto. Para isso vamos fazer uma função que irá fazer os cálculos e projetar o tamanho populacional com crescimento logístico discreto e com crescimento exponencial estocástico discreto.  Este exercício tem como objetivo fazer uma comparação do crescimento logístico discreto com o crescimento exponencial estocástico discreto. Para isso vamos fazer uma função que irá fazer os cálculos e projetar o tamanho populacional com crescimento logístico discreto e com crescimento exponencial estocástico discreto. 
  
-**Roteiro [[ecopop:exercicios::exe3III|Exercício III.2]]**+**Roteiro [[:exercicios::exe3III|Exercício III.2]]**
  
 ==== III.3. Extra: Logístico Estocástico ==== ==== III.3. Extra: Logístico Estocástico ====
Linha 107: Linha 107:
 Nesse exercício vamos introduzir um variação estocástica ambiental no modelo logístico, modificando a premissa que o fator de crescimento discreto (rd) não varia no tempo. Diferente do exercício de modelo exponencial estocástico, agora vamos modelar a variação no crescimento discreto (rd).  Nesse exercício vamos introduzir um variação estocástica ambiental no modelo logístico, modificando a premissa que o fator de crescimento discreto (rd) não varia no tempo. Diferente do exercício de modelo exponencial estocástico, agora vamos modelar a variação no crescimento discreto (rd). 
  
-**roteiro [[ecopop:exercicios::exe3VI|Exercício III.3]] **+**roteiro [[:exercicios::exe3VI|Exercício III.3]] **
  
 ==== III.4. Integração Numérica do Crescimento Logístico ==== ==== III.4. Integração Numérica do Crescimento Logístico ====
Linha 114: Linha 114:
 O pacote deSolve do R contém a função **ode** O pacote deSolve do R contém a função **ode**
  
-Roteiro [[ecopop:exercicios:exe3iv|Exercício III.4]]   +Roteiro [[:exercicios:exe3iv|Exercício III.4]]   
  
 ==== III.5. Crescimento Logístico com Retardo ==== ==== III.5. Crescimento Logístico com Retardo ====
-{{:ecopop:exercicios:lorenz3d.gif?200  |  }}+{{:exercicios:lorenz3d.gif?200  |  }}
 O crescimento logístico com retardo pode ter trajetórias muito complexas, como vimos nos modelos logísticos com crescimento discreto.  O crescimento logístico com retardo pode ter trajetórias muito complexas, como vimos nos modelos logísticos com crescimento discreto. 
 Vamos simular algumas trajetórias para esses modelos contínuos com retardo. A solução numérica de uma equação diferencial não é trivial. Vamos usar o pacote PBSddsolve do R.   Vamos simular algumas trajetórias para esses modelos contínuos com retardo. A solução numérica de uma equação diferencial não é trivial. Vamos usar o pacote PBSddsolve do R.  
  
-Roteiro [[ecopop:exercicios:exe3iv#Crescimento Logístico com Retardo|Exercício III.5]]   +Roteiro [[:exercicios:exe3iv#Crescimento Logístico com Retardo|Exercício III.5]]   
 ----- -----
  
Linha 131: Linha 131:
  
  
-** Roteiro exercício: [[ecopop:exercicios::exec_iv]]**+** Roteiro exercício: [[:exercicios::exec_iv]]**
 ===== Exercício V - Tabelas de Vida ===== ===== Exercício V - Tabelas de Vida =====
  
exercicios/exe_r.1336082018.txt.gz · Última modificação: 2024/01/09 18:17 (edição externa)
www.chimeric.de Creative Commons License Valid CSS Driven by DokuWiki do yourself a favour and use a real browser - get firefox!! Recent changes RSS feed Valid XHTML 1.0