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Curso Natal 2013

Bem vindo(a). Aqui você encontrará a programação de nossa disciplina, ministrada entre 4 e 8 de fevereiro de 2013 na Universidade Federal do Rio Grande do Norte, e outras informações importantes. Fique atento, há algumas atividades prévias a cumprir antes do início das aulas, veja Atividades Preparatórias.

Avaliação

Veja as atividades preparatórias que devem ser realizadas antes do curso Atividades Preparatórias

Informações Gerais

Disciplina oferecida pelo Programa de Pos-graduação em ecologia da UFRN, baseada em disciplina do programa de Ecologia da USP. Nessa versão a disciplina será concentrada em uma semana, portanto para que os alunos tirem o máximo de proveito é necessário que se programem para uma dedicação intensa e integral à disciplina.

Objetivos

O curso foi criado e é mantido por um grupo de professores que compartilham o entusiasmo pelo ambiente R, por propiciar um uso mais crítico da estatística na pesquisa científica.

O objetivo amplo deste grupo é divulgar o ambiente R para estudantes da ecologia e áreas afins, como maneira de fomentar este uso crítico.

O foco do curso é a introdução à estrutura e uso da linguagem. É inevitável abordar alguns conceitos estatísticos, mas este é um curso do uso da linguagem R, e não sobre estatística, considerada básica para pós-graduandos da área. Para maiores informações veja a página de introdução geral do WIKI

Professores

  • Alexandre Adalardo de Oliveira, Lab. Ecologia de Florestas Tropicais LABTROP - IBUSP (adalardo@usp.br)
  • Camila de Toledo Castanho - IBUSP (ctcastanho@gmail.com)

Monitores

Geralmente contamos com um grupo grande de monitores que auxiliam os professores principalmente no atendimento aos alunos durante os tutoriais e exercícios. O aprendizado de uma linguagem é um trabalho árduo, principalmente no início, ainda mais em um linguagem lógica em que uma vírgula a mais pode tornar uma sintaxe completamente sem sentido. Como esses monitores não puderam estar presentes nessa versão, muitos deles se dispuseram a tirar dúvidas dos alunos pelo nosso fórum. Portanto, tentaremos manter um rodízio de atendimento online através desse canal, durante o curso.

  • André Chalom - PG Bioinformática, IME -USP
  • Daniel Caetano - LAGE, IB - USP
  • Diogo Melo - PG Genética, IB - USP
  • Fernando Rossine - PG Ecologia, IB - USP
  • Gustavo Burin - PG Botânica, IB - USP
  • Marcelo Awade - PG Ecologia, IB - USP
  • Sara Mortara - PG Ecologia, IB - USP

Período e Horários

  • Disciplina condensada, 04 a 08 de fevereiro de 2013.
  • Aulas manhã das 8:30-12:30 h e tardes das 14:00- 17:30 h.
  • Atendimento online pelo forum 9:00-18:00 horas.

Locais das aulas

Aulas Teóricas
Exercícios práticos

Traga um notebook com o R instalado veja as atividades preparatórias.

Programação

  • Faça as Atividades Preparatórias antes do primeiro dia de aula.
  • A disciplina consiste de aulas teóricas, seguidas de tutoriais e exercícios com o apoio dos monitores.
  • Os professores e monitores acompanham as dúvidas dos alunos pelo Forum online.
Primeira Semana
Data Período Local Assunto Instrutor(es)
04 fev8:30-10:00 PG-UFRNFilosofia e histórico da linguagem R, Introdução à linguagem R Alexandre
04 fev10:30-12:30PG-UFRN Tira-dúvidas dos Tutoriais de introdução ao R Professores
04 fev14:00-15:30PG-UFRN Funções matemáticas e estatísticas no R Alexandre & Camila
04 fev 16:00-18:00 PG-UFRN Tutorial de Funções Camila
05 fev 8:30-9:30PG-UFRN Tira Dúvidas Funções Matemáticas Alexandre & Camila
05 fev 9:30-12:30PG-UFRN Leitura e Manipulação de Dados Alexandre
05 fev 14:00-18:00 PG-UFRN Tutorial Manipulação de dados Professores/Monitores
05 fev 8:30-9:30PG-UFRN Tira Dúvidas Manipulação de Dados Alexandre & Camila
05 fev 9:30-12:30PG-UFRN Análise Exploratória de Dados Alexandre
05 fev 14:00-18:00PG-UFRN Tutorial Análise Exploratória de Dados Monitores
06 fev 8:30-9:30PG-UFRN Tira Dúvidas Análise Exploratória de Dados Alexandre & Camila
06 fev 9:30-12:30PG-UFRN Gráficos Alexandre
06 fev 14:00-18:00 PG-UFRN Tutorial Gráficos Monitores
07 fev 8:30-9:30PG-UFRN Tira Dúvidas Gráficos Alexandre & Camila
07 fev 9:30-12:30PG-UFRN Testes de significância Alexandre
07 fev 14:00-18:00 PG-UFRN Tutorial Testes de significância Monitores
08 fev 8:30-9:30PG-UFRN Tira Dúvidas Testes de significância Alexandre & Camila
08 fev 9:30-12:30PG-UFRN Simulações e Noções de Programação Alexandre
08 fev 14:00-18:00 PG-UFRN Tutorial Simulações e Programação Monitores

Bibliografia Básica

Livros

William N. Venables and Brian D. Ripley. Modern Applied Statistics with S. Fourth Edition. Springer, New York, 2002. Conhecido na comunidade R como “The Book”, é a referência básica do usuário, mas é preciso alguma experiência para aproveitá-lo bem. Seu pacote companheiro é o MASS1), que faz parte da instalação básica do R. Visite o site do livro para atualizações, exercícios e muito mais.

John Fox. An R and S-Plus Companion to Applied Regression. Sage Publications, Thousand Oaks, CA, USA, 2002. Excelente livro sobre regressão linear, e uma ótima introdução à construção de modelos no R. O pacote companheiro, car, tem ótimas funções para diagnóstico de regressões. Visite também o site do livro.

John Verzani. Using R for Introductory Statistics. Chapman & Hall/CRC, Boca Raton, FL, 2005. Derivado de manual disponível gratuitamente no site do autor, esta é uma das melhores introduções à linguagem para principiantes. Muito didático e com ótimos exercícios. Veja também o site do livro, e o pacote usingR.

Crawley, M. J. The R Book. Wiley, New York, 2007. Um livro muito completo e feito por um ecólogo, para ensinar estatística e a linguagem. Referência obrigatória para pessoas da área de biologia, principalmente de ecologia. Veja também o site do livro.

Documentação On Line

NOTA: Selecionamos aqui três manuais on-line que nos parecem boas introduções. Há muito mais na seção Contributed Documentation do site do R.

Venables, W.; Smith, D.M; & R Development Team An Introduction to R. Manual online. Manual oficial de introdução ao R.

Carlos Alzola and Frank E. Harrell An Introduction to S and the Hmisc and Design Libraries O Pacote Hmisc veio do S-Plus, e tem várias funções muito úteis para manipulação e análise exploratória de dados. O manual é extenso e é uma referência muito completa sobre a linguagem S.

Petra Kuhnert and Bill Venables An Introduction to R: Software for Statistical Modelling & Computing. Apostila de 360 páginas de curso de Introdução ao R, além dos scripts de aula e conjuntos de dados.

Outros Recursos

  • Taskviews: São listas comentadas dos pacotes do R para uma certa área ou tema, mantidas no CRAN2). Para nossa área, p.ex, há os views Environmetrics, Multivariate, Genetics, Spatial. Todo espelho de CRAN mantém uma cópia dos taskviews. Para o espelho da FMV-USP o link é http://www.vps.fmvz.usp.br/CRAN/web/views/.
  • CRANTASTIC!: Excelente sítio com resumos de todos os pacotes do CRAN3). Tem recursos para buscas de pacotes e funções por assuntos, resumos de cada pacote, avaliações de pacotes e muito mais. Juntamente com as taskviews, é o recurso básico para encontrar o pacote que você busca no R.
  • The R Journal: periódico mantido pelo R Project, onde são publicados artigos sobre novos pacotes, dicas para programadores e usuários, e uso do R nas mais variadas aplicações estatísticas.
  • Journal of Statistical Software: tem sido o principal veículo sobre análises e novos pacotes no R. Muitos dos principais pacotes usados em ecologia e biologia têm artigos com exemplos de aplicação neste periódico. Há fascículos especiais, incluindo um sobre uso do R em ecologia, e outro sobre análises de redes (com ênfase para dados de ciências sociais).
  • Quick R, de Rob Kabakoff: um guia rápido on line muito bem organizado e fácil de consultar. Foi criado para facilitar a migração de usuários de outros pacotes, mas é um recurso de consulta rápida útil para todos.
  • The R Wikibook: manual muito completo na coleção de Wiki Books.
1) este e os demais pacotes citados aqui estão disponíveis no CRAN
2) , 3) Comprehensive R Archive Network, repositório oficial dos programas e pacotes do R
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